Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms