Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms