Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BGC1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BGC1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGC1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGC1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGC1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms