Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms