Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms