Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms