Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5bQ80Y84 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5bQ80Y84 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5bQ80Y84 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5bQ80Y84 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5bQ80Y84 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5bQ80Y84 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5bQ80Y84 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5bQ80Y84 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5bQ80Y84 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms