Protein–RNA interactions for Protein: Q80X53

Ccdc116, Coiled-coil domain-containing protein 116, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc116Q80X53 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc116Q80X53 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc116Q80X53 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc116Q80X53 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc116Q80X53 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc116Q80X53 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc116Q80X53 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc116Q80X53 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc116Q80X53 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc116Q80X53 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc116Q80X53 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc116Q80X53 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc116Q80X53 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc116Q80X53 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc116Q80X53 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc116Q80X53 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc116Q80X53 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc116Q80X53 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms