Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk9Q80W65 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms