Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms