Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
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