Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2q1Q7TSS2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms