Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms