Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms