Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms