Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Prrc2bQ7TPM1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms