Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU7

Letm2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm2Q7TNU7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Letm2Q7TNU7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letm2Q7TNU7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms