Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6aQ78XR0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms