Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ubfd1Q78JW9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ubfd1Q78JW9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ubfd1Q78JW9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ubfd1Q78JW9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ubfd1Q78JW9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Ubfd1Q78JW9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ubfd1Q78JW9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ubfd1Q78JW9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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