Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Eci3Q78JN3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms