Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmed3Q78IS1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms