Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynmQ70IV5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms