Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl35Q6ZWV7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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