Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms