Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms