Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cnot1Q6ZQ08 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms