Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Smpd4Q6ZPR5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms