Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb3Q6XAS4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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