Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms