Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms