Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.7 ms