Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cachd1Q6PDJ1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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