Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms