Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg2aQ6P4T0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg2aQ6P4T0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms