Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A8

Bckdhb, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhbQ6P3A8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BckdhbQ6P3A8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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