Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms