Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fndc3bQ6NWW9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms