Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms