Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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NipblQ6KCD5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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NipblQ6KCD5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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NipblQ6KCD5 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms