Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm4Q6IRU2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms