Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms