Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Carmil1Q6EDY6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms