Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop58Q6DFW4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.6 ms