Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zcchc2Q69ZB8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zcchc2Q69ZB8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms