Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pkp4Q68FH0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pkp4Q68FH0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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