Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kiaa1549Q68FD9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms