Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CltcQ68FD5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltcQ68FD5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltcQ68FD5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltcQ68FD5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CltcQ68FD5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltcQ68FD5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CltcQ68FD5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CltcQ68FD5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms