Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp4eQ66X19 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms