Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms