Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms